本會稽查大隊採二十四小時三班制執行稽查巡防工作。為強化巡防績效，設有六十處巡邏箱，且依據流域範圍及任務需要，分為四分隊執行例行巡防及查緝小組機動巡守作業，各分隊範圍及工作如次：

分　　隊　　巡　　防　　範　　圍

  第一分隊
 高屏溪本流含武洛溪排水(里嶺大橋至出海口)
 
第二分隊
 隘寮溪(至匯流口)及高屏溪大樹過水便道上游(屏東端)
 
第三分隊
 荖濃溪(至高屏溪匯流口)
 
第四分隊
 旗山溪(至里嶺大橋)及美濃溪
 
查緝小組
 機動支援各隊業務、辦理專案業務及協助高雄縣及屏東縣政府執行國土保安、盜(擅)採陸砂及漁船用油非法流用等稽查巡守工作。
 
 

 稽  查  業  務

一、掌理高屏溪流域(高屏溪本流、隘寮溪、荖農溪、濁口溪、旗山溪及美濃溪等主支流)河川區域線內巡防稽查及有關違法案件取締工作。
二、協助高、屏二縣政府執行國土保安、盜(擅)採砂石及漁船優惠用油非法流用之稽查取締工作。
三、各種舉發案件之稽查。
四、民眾陳情案件之稽查。
五、查報及通報流程如下：

◎ 陳情舉發電話:0800800995、(08)7515571~4
◎ 受理時間:0~24小時